Une structure animatrice, responsable du suivi, de l’animation et de la mise en œuvre du DOCOB est désignée par le Comité de Pilotage.
Elle assure l’animation, l’information, la sensibilisation, l’assistance technique à l’élaboration des projets et au montage des dossiers.
Elle a aussi pour rôle de recenser les bénéficiaires qui sont prêts à mettre en œuvre des mesures contractuelles via des contrats Natura 2000.
Afin de prendre en compte l’ensemble des problématiques d’un site et de s’entourer des compétences et acteurs spécialisés, la structure animatrice peut travailler en partenariat avec d'autres structures tel que la Chambre d'agriculture ou le Centre régional de la propriété forestière.
Le Conseil Régional Ile-de-France a été désigné structure animatrice.
L'animation qui a débuté en janvier 2012 a été confiée à l'agence des espaces verts de la région Ile-de-France.